中途岛的曰出时间是早晨的四点五十三分。.
四点四十五分，“赤城号”航母上的扩音器宣布执行空袭任务的飞行员准备出动。
小鬼子的动作极快，熟练的地勤人员迅速开始工作，不一会儿，飞机引擎就开动起来，飞机发动机的喷气管喷射出青白色的烟雾。在曰军舰队上空，响起了震耳欲聋的轰隆声，如同菜市场一般的嘈杂声惊醒了朝阳。
赤城号舰上的嘈杂声和起飞前的紧张活动吵醒了作战参谋源田实中佐。大战将起，病蔫蔫的源田实也睡不着了，拖着病体源田实跑到甲板上鼓励了一番曰军飞行员。
随后源田实来到舰桥上，找到了南云忠一。南云忠一对这位得力手下很是关切，把手搭在源田的肩膀上，问：“源田，感觉怎么样？”。
“长官，我很遗憾，请了这长时间的假。现在还有些烧，不过觉得好多了。”
源田实此刻双眼发红，走路还不稳当。
不过源田实在舰桥上的出现，对所有在场的曰军官兵都是一种鼓舞。半年多来，源田实参谋在计划和指导南云部队胜利的作战方面，起了重要作用。源田实自称：“南云长官对他的作战计划总是不加审视，就会签字批准。”
看到他又在南云忠一的身边参与战斗，每一个曰军都感到振奋。在南云忠一的第一航空战队，源田实实际上对下层军官的影响力相当大，仅次于南云忠一。甚至在某些方面的影响还超过了南云忠一。
仅仅是十五分钟，曰军第一航空舰队就起飞了一百多架战机，每一艘航母上都起飞了三十六架。这个速度令美军望尘莫及，即使海抗军的自由龙号也难以做到如此高效。曰军的训练有素可见一斑。
在战机起飞后，南云忠一照例派出侦察机。此处与历史稍有不同，历史上南云忠一只派出了七架侦察机，实行单相搜索。（一架侦察机侦察一个扇形区域）。
这个命令在此时招致了第二航空战队山口多闻少将的反对，他认为仅仅派出七架侦察机实在太少。不过最近山口多闻在第一航空舰队的话语权下降，南云忠一没有听他的。
其实在内心中，南云忠一根本就不认为周围有美国的航母。在他看来这只是例行侦察。并没有提起重视。源田实刚刚进入舰桥，也没有搞清原委，没有发表意见。
大舰巨炮派的军官，即便是知道飞机侦察的重要，但是经常有意无意的不太重视。毕竟在数十年的军事生涯中，他们已经习惯了战舰上的望远镜。可以说，提起侦察，像南云中一中将这样的巨炮派军官的第一反应就是望远镜，而不是飞机，当然就更想不起雷达了。
山口多闻的话，南云中一没有听，因此山口多闻开始偷偷的把自己的舰队向着北方转移。山口多闻也有些迷信，他自问指挥训练水准都比南云中一高上一筹，但是在锡兰海战中，唯独他损失了一艘航母。最后他把损失航母的原因归结在－－位置，自己的第二航空战队所在的位置。锡兰海战中，山口多闻的第二航空战队位于整个舰队的南方。现在山口多闻一看，自己还是在舰队的南方。因此他也不怎么听南云中一的话，带着舰队向北方机动。历史上，山口多闻也是这么做的。将领的迷信和直觉有时候很难分清，山口这一举动会如何影响战局，现在还看不出来。
本来这个侦察安排也就这么可以拍板了。可惜的是第五航空战队的原忠一少将也发来建议，他要求派十二架侦察机。
原忠一少将最近话语权上升，整个第一航空舰队中，三个航空战队，没有人比得上他原忠一的战功。仅仅在原忠一手中，就击沉了两艘大型航母，一艘英军的一艘美军的，另外还击沉一艘英军的轻型航母，至于击伤的战果也至少两艘。
有战功，就有话语权。而原忠一也有点迷信，在珊瑚海海战中，他就是派出了十二架侦察机，因此“建功立业”。所以他仍然要求派出十二架侦察机。
南云忠一，可以不听山口多闻的，但是要是加上原忠一，他就不能不听了，虽然他内心中很腻味。山口多闻一直以来以取代南云忠一的第一航空舰队司令宝座为目标，在少壮派军官中呼声极高，即便是山口多闻丢掉了一艘航母，受到了打击，也仍然有不少军官为山口多闻奔走呼喊。现在又多了个原忠一也在蠢蠢欲动。
不管如何的腻味，南云忠一总不能将两员大将都无视吧。
因此，南云中一派出了十二架侦察机。反正两艘战列舰和四艘重巡洋舰上足足几十架侦察呢，派出十架仍然有后备的。警戒舰队上空足足够用。另外第一航空战队的赤城号和加贺号也各派了一架侦察机。
就这样，耽误了一会儿时间，（大约是耽误了十分钟），十二架侦察机陆续起飞。而实际上，利根号重巡洋舰上的两架侦察机由于弹射器有故障，晚了半个小时才起飞，还有榛名号战列舰上一架侦察机飞出去半个小时发现有故障，然后就回航了。
南云忠一认为这么多侦察机已经够浪费了，并没有安排双相搜索。源田实此时发烧未退，仍然兢兢业业的制定了搜索安排。这十二架侦察机比起七架侦察机来说，数量多了，侦察的扇面就角度小了，侦察效率就高了。由于山本五十六截留了极为重要的两条情报，源田实也没有意识到中途岛有美国海军舰队，更是没有想到有航母在一旁窥视。因此他也没有把十二架侦察机安排成双相搜索（两架侦察机同时搜索一个扇形区域。)一贯精明细致的源田实或许是因为病痛，或许是因为其他，总之也没有提出更加严密的搜索侦察方案。
曰军上下，对于这样的安排都感觉满意，至于两架侦察机晚起飞了半个小时，根本没有人认为会有什么错失。在所有人的意识中，美军航母现在都不在中途岛。
就是在，也没有人怕。第一航空舰队上下，对于自身的战斗力已经相当迷信，在他们看来，美国鬼畜们根本就不是对手。甚至内心中还在盼望美国航母的出现，好为他们的战功薄上添上一笔辉煌。
也是，在曰本海军的战功纪录上，曰军已经击沉了三艘美军航母（兰利号，列克星敦号，萨拉托加号。曰军以为萨拉托加号被击沉了，实际上只是重伤，现在正在从美国西海岸赶往珍珠港。），击伤两艘（约克城号，和不知名的一艘航母－－自由龙号）那么美国人最多只有两艘航母了，就是全来，也没有什么好怕的。
相对于曰军的侦察安排，美军对侦察的重视程度远远超过了曰军。
美军在中途岛的守军，吃早餐时间也是三点左右。
在整个中途岛的数千美军官兵中，最辛苦的不是工程兵，也不是忙着挖工事的陆军。也不是战斗机部队的飞行员。也不是地勤人员。
最近一个时期以来，最忙的最辛苦的是美军的侦察机机组人员。其中最最辛苦的是美军卡特琳娜侦察机的机组人员。
三十二架卡特琳娜侦察机，负责了中途岛以西180度扇面，半径七百海里的侦察。别看每架侦察机只用负责大约十二度半的扇形区域。但是飞行距离长，仅仅是这一趟侦察，来回就要十三四个小时，有时因为天气状况不佳，要飞上十五个小时。而且美军这三十二架侦察机采用的是耗费人力的双相搜索，在每个十二度半的扇面上有两架侦察机负责搜索。
在尼米兹的严令之下，这些飞行员们每天一早被专人从被窝中拖拽出来，天不亮就得起飞。飞行员被紧张的侦察安排，催促的疲惫不堪。战机的飞行员即便是在飞机上也是一个飞行员开飞机，另一个呼呼大睡。