董卓带领手下直达长安，为了安抚众将，他召集众将说：“关东诸将战败几次了，干不出什么名堂了。只有孙坚有点生气，各位将军要小心。”于是他派东中郎将董越驻扎黾池，中郎将段煨驻扎华阴，中郎将牛辅驻扎安邑，其余中郎将、校尉分布在各县，以抵御山东的军队。然后建都长安就在紧锣密鼓中进行着。

牛辅不能退敌，但也被击败，所以牛辅自然与“白波贼”僵持，一部分兵力被牵制。黄巾余党十余万，战斗力固然不强，造成的影响也不会很大，但这件事对于董卓来说，是一个不容忽视的大事。本来就没有完全在洛阳站稳脚跟，黄巾余党又来sao扰，真让董卓头疼，这也是董卓丢弃洛阳迁都长安的原因之一。

董卓的两位心腹爱将是胡轸与吕布，但是两人显然不和。李催和樊稠不和，到后来的李催和郭汜不和。武将尚且如此，那些军师、谋士之间也融洽不到哪儿去。但是董卓是个精明人，他不会不清楚他手下人之间的事，只是处理起来不是那么简单的事。况且他手下都是虎狼之将，护着谁偏袒谁，后果他是知道的。所以凭这些问题，他想这些将领在洛阳附近与关东联军交战时间长了，万一临阵哗变，可不是闹着玩的，不如战略后撤，到自己的地盘，稳稳控制住局势，也收收人心，然后再做打算。这也是他放弃洛阳到长安建都的另外一种想法。

董卓废少帝是为了树立威信，迁都一来避其锋芒，二来可以将皇权拉入自己管辖的势力范围之内，来更好的挟天子以令诸侯，使得关东联军营救天子的计划流产。这样一来反而更难约束关东以外的军阀势力，以至发展至群雄割据的局面。

洛阳时，董卓就有了迁都长安的想法，但内心也有一点犹豫不决，于是召公卿来，看看公卿们有什么看法。当时司徒杨彪提出：“迁都乃是天下大事，如今天下太平，无故就迁都，担心百姓被惊扰，列强、流寇趁迁都聚众引起sao乱怎么办？”

董卓的却说：“关中地区土地肥沃、富饶，以前秦朝就是在关中地区起家而灭了六国。如今要是迁徙到长安，假如关东联军胆敢有轻举妄动的，用我强大兵力足以震慑他们。”关中地区金城千里、号称“天府之国”和“四塞之国”。从秦汉之际的国内形势来看，关中、关东人口最多、是最为发达的地区。而从政治、经济、军事的地位上看，关中地区处于极其有利的位置。首先，它境内土地肥沃，物产丰富，又有附近巴蜀地区农业和西北畜牧业的支持，经济发达；其次，它四周为秦岭、北山山系及黄河所环绕，有四塞为固；北有萧关，西南有散关，东南有武关，东有函谷关等，形成一个进可以攻，退可以守的特殊有利地位。正是这种得天独厚的地理优势，保证了秦国的发展并消灭了东方六国，完成全国政治、经济、文化的统一。何况长安是关中地区的中心城市，又有西汉建都根基，选择迁都长安是非常合适的。”董卓这段话已经流露出他早有了预见，关东联军有可能要攻击他，迁都长安是他唯一的选择。

司徒杨彪说：“如果迁都，动起来很容易，说迁过去就迁过去，但迁都以后想要安定却很难。又因为长安旧皇宫已经败落了，修复起来也很麻烦。”

董卓似乎早已经考察好了，他说：“在杜陵南山脚下，有制造修建城垣专用材料砖窑、瓦窑厂好几千家。另外，木料也不愁，可以从西凉伐木运至长安。”

杨彪见董卓主意也定也就无话可说。

董卓在面对关东联军时，其实真正让他恐惧的不是那支数量庞大的联军部队，而是害怕其中的几个人。这几个人是，曹cao，孙坚，袁术和韩馥。

董卓在迁都之前，曾找过曹cao共谋大事，把自己的实力、计划都和曹cao讲了，结果董卓没有想到，曹cao没有被自己拉拢，反而起兵反叛。曹cao的才能董卓自然了解，能文能武，年富力强。而曹cao最了解董卓的底细，使董卓不得不作出一些战略的改变。